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六盘山森林自然保护区有针叶林、阔叶林、针阔混交林、中生落叶灌丛、耐旱落叶灌丛、草甸、草原等植被生境和自然景观，独特的自然生境孕育了保护区生物资源的多样性。
依赖六盘山森林群落生存、繁衍的野生动植物极为丰富，是鸟类生存、迁徙及其他野生动物的栖息繁殖地，其中有许多是珍稀特有物种。
六盘山自然保护区核心区和缓冲区内无居民生活，人为干扰极少，基本处于自然状态，为野生动物提供了丰富的食物和良好的生存、繁衍、进化空间，对物种的保存和延续具有重要作用，是重要的物种遗传基因库。
二、森林涵养水源作用
六盘山自然保护区森林涵养水源及凋落物的积累与分解是控制天然植被结构和森林生态系统功能的一个复杂、重要的因素。
森林林下枯枝落叶层作为森林生态系统中重要的结构层次，不仅影响林地土壤的发育、水热状况、通气状况、营养元素的循环及林地生物种群的类型及数量，而且结构疏松，透水性和持水能力良好，能够削弱雨滴对土壤的直接击溅，吸持一部分降水，减少入渗到土壤中的水量，减少地表径流的产生，起到保持水土和涵养水源的作用。
同时森林凋落物对土壤肥力、幼苗更新、杂草生长和植物生长等方面都有积极影响，可以增加土壤有机质，提高土壤含水量，降低土壤温度，增加土壤酶的种类，提高土壤酶活力及土壤微生物的多样性。
六盘山地处内蒙古高原、黄土高原和秦岭的交汇处，山间溪流众多，河网密集，是黄河的重要支流——泾河的发源地。
同时，林区还有部分河流流入清水河与渭河，是黄土高原水资源最为丰富的地区，也是影响我国西部半干旱区天然降雨的重要区域。
因此，六盘山的区位特点决定了其水源涵养作用的重要性和不可替代性。
三、气候调节功能
六盘山森林植被茂密，形成了乔木—灌木—草本—枯枝落叶层合理的立体结构类型，层层拦截天然降水，调节河川径流，具有重要的水源涵养作用，受内蒙古高原、黄土高原干旱气候和秦岭湿润气候的影响，小气候变化明显，是重要的生态屏障。
从气温空间分布来看，六盘山地区年平均气温为0.79℃～6.96℃。
气温的地理分布在纬度上的差异并不显著，南北仅占半个纬度，而海拔高度对气温分布的影响较为突出。
该区的平均气温垂直递减率为0.51℃每百米，与自由大气中0.65℃每百米的直减率相近。
以山脊线为界将山体分为东西坡，东坡的气温直减率为0.4℃每百米，相比西坡的0.5℃每百米较小，这是因为夏季盛行东南季风，西坡焚风效应明显，使气温直减率增大。
气温地理分布主要受海拔高度的影响。
[1]程积民、余治家、朱仁斌等：《六盘山国家级自然保护区综合科学考察报告》，北京：科学出版社，2013。
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